《最终幻想13》的剧情主要围绕被水晶守护着漂浮在天空的乌托邦——茧,以及外界的“パルス”构成的世界展开。在这个世界里,人们被分为上界(茧)和下界(格兰帕鲁斯),由人和水晶生物(法尔希)共同生存。上界拥有高科技,人们从不担心衣食,由上界法尔希提供人类需要的一切,人们被圈养在茧里;而下界是巨大的大陆,人们把法尔希当神一样供奉,科技比上界差一些。然而,上界和下界的法尔希相互敌视,发生战争。他们选中人类,赐予人类力量与使命,被选中者称为露希,被送到对方地盘充当战争工具。
故事从茧被外界异物入侵开始,为了维持茧内的安定,管理者圣府决定把受到外界异物影响的人们强制发配到下界。游戏的剧情主要就是讲述在这样的背景下,被发配到下界的主角们如何与命运抗争,并逐渐揭开隐藏在这个世界背后的真相的故事。在这个过程中,主角们会遇到各种各样的人和事,经历种种困难和挑战,也会收获友情、爱情和成长。
《最终幻想13》的剧情融合了魔法和科技,展现了一个充满未知和可能性的未来世界。同时,它也探讨了人性、命运、自由等深刻的主题,给玩家带来了深刻的思考和感动。